ほくろができる原因とは完全解明されているわけではないそうです。ほくろができる原因としては下記のことが考えられます。

①にきびやひげ剃り、衣類の摩擦などによる外傷・外的刺激によるほくろ
②体質によるほくろ（体質に影響されやすい）
③紫外線によるほくろ

紫外線のがほくろの原因である場合ですが、人間は、紫外線から肌を守るためにメラニンをつくり出します。
しかし、メラニンをつくり出す細胞であるメラノサイトが、なんらかの異常でメラニンを過剰につくり出した結果、ほくろとなります。

生まれたばかりの赤ちゃんは、紫外線をまだ浴びた事がないので、ほくろがありません。
しかし、紫外線を浴び続けるようになり、2歳から3歳くらいになると皮膚表面にほくろが出てきます。